Σύμφωνα με όσα έγιναν γνωστά, ο Μητροπολίτης Κυδωνιών Αθηναγόρας, πρώην Μέγας Αρχιμανδρίτης του Οικουμενικού Πατριαρχείου όταν εισήλθε στο ναό για να προσκυνήσει δέχθηκε επίθεση από τον Μέγα Κατηχητή, Αρχιμανδρίτη Χρύσανθο, ο οποίος απροειδοποίητα άρχισε να γρονθοκοπεί τον Μητροπολίτη.
Τους δυο άνδρες προσπάθησε να χωρίσει ο νεωκόρος, κάτι που κατάφερε αφού προηγουμένως οι δυο ιερείς ανταλλάσουν ύβρεις στα τουρκικά εντός της εκκλησίας. Σύμφωνα με πληροφορίες, οι δυο ιερείς είχαν μια προσωπική διαμάχη μεταξύ τους για εκκλησιαστικές – υπηρεσιακές διαφορές που επέλεξαν να την λύσουν εντός του ναού και με…ξύλο, χωρίς να υπολογίσουν ότι η συμπεριφορά τους καταγραφόταν από τις κάμερες του ναού.
Ο Αρχιμανδρίτης Χρύσανθος ήθελε η ακολουθία να πραγματοποιείται στις 3 μ.μ, ενώ ο Μητροπολίτης Αθηναγόρας πρότεινε να τελείται στις 4 μ.μ. Το απόγευμα της Τρίτης ο Μητροπολίτης αγνοώντας την σχετική ανακοίνωση για τις 3 το μεσημέρι εμφανίστηκε μια ώρα αργότερα και απευθυνόμενος προς τον αρχιμανδρίτη, του είπε, «Χρύσανθε δεν θα σε χρειαστώ, μπορείς να φύγεις». Τότε ο Αρχιμανδρίτης «βγήκε εκτός εαυτού» και επιτέθηκε με γροθιές στον Μητροπολίτη.
Ο Μητροπολίτης Αθηναγόρας κατέθεσε μήνυση εναντίον του Αρχιμανδρίτη Χρύσανθου ο οποίος αναζητείται από την τουρκική αστυνομία, ενώ σύμφωνα με πληροφορίες οι δύο ιερωμένοι φέρονται να είχαν και στο παρελθόν διαμάχες για διάφορα θέματα με αποτέλεσμα να έχουν προκαλέσει μεγάλη αναστάτωση στο Οικουμενικό Πατριαρχείο.